Многолетнее растение высотой до 60 см. Корневище диаметром 5—10 мм, бурое, почти горизонтальное или косо восходящее. Стебли многочисленные, простые, реже ветвистые, прямые, высотой 30—80 см, густо опушённые многоклеточными волосками. Листья сердцевидно-яйцевидные, длиной 4—13 см, шириной 3—10 см, острые, края листовой пластинки городчатые; нижние листья на черешках равных пластинки, верхние — короткочерешковые или сидячие. Соцветия простые или чаще с одной-двумя парами длинных ветвей, из 20—40-цветковых ложных мутовок; чашечка трубчатая, часто лиловатая; венчик фиолетовый, иногда белый, вдвое длиннее чашечки, двугубый. Орешки округло эллиптические, светло-бурые, иногда тёмно-бурые, гладкие, длиной 1,5—5 мм. Цветёт в июне — сентябре. Плоды созревают в августе — сентябре. Нектарник кольцом опоясывает завязь. Нектар накапливается в трубочке венчика, занимая около трети её, и хорошо доступен для пчёл. Они посещают цветки шалфея весь день. Нектаровыделение обильное, наиболее интенсивное в период от полного опыления до оплодотворения. Наиболее нектароносны цветки в жаркую погоду — 25—30 °С и умеренно влажную погоду.