Трава пустырника стабилизирует сердечный ритм и укрепляет миокард, оказывает спазмолитическое и противосудорожное действие, снижает артериальное давление, уровень холестерина в крови, глюкозы, пировиноградной и молочной кислот, стабилизирует белковый обмен и выводит лишние жиры. Пустырник эффективен при лечении желудочно-кишечных заболеваний, особенно при спазмах желудка и Катаре толстого кишечника. Обладает мочегонным, противовоспалительным и отхаркивающим свойствами. Трава пустырника оказывает успокаивающее действие при нервных расстройствах, бессоннице, истерии, психастении, вегето-сосудистой дистонии, тиреотоксикозе. Трава пустырника в гинекологии назначается при климактерическом синдроме и болезненных или неустойчивых состояниях. В гастроэнтерологии растение применяют при спазмах желудка, метеоризме и кишечных неврозах. Трава пустырника в народной медицине дополнительно применяется при маточных кровотечениях, отеках, колитах, гастритах и простудных заболеваниях, хроническом кашле, сердечно-сосудистых заболеваниях, болезни Грейвса, эпилепсии. Семена используются для лечения глаукомы. Как общеукрепляющее и седативное средство применяется при хорее, туберкулезе и хлорозе.